Epigenetische Kontrolle von rRNA Genen

in Heidelberg

Epigenetische Kontrolle von rRNA Genen

Die Gene, die für ribosomale RNA kodieren, liegen in zwei distinkten Chromatin-Strukturen vor; einer ‚offenen’, transkriptionell aktiven und einer kompakten, transkriptionell reprimierten Form. Die molekularen Mechanismen, die das Abschalten (‘silencing’) des rDNA-Lokus bewirken, sind noch weitgehend unverstanden. Unsere Gruppe untersucht die molekularen Mechanismen, die rRNA Gene auf epigenetischer Ebene regulieren. Wir haben einen Proteinkomplex, NoRC (‚Nucleolar Remodeling Complex’), identifiziert, der die Verpackung und Stillegung von rRNA Genen bewirkt. NoRC ist mit 150-250 nt RNAs assoziiert, die dem rDNA Promotor komplementär sind. Diese Transkripte werden von nicht-kodierenden, zwischen den rRNA-Genen liegenden Sequenzen abgelesen und sind sowohl für Heterochromatinbildung und ‚gene silencing’ unerläßlich (Mayer et al. 2006; 2008). Wir untersuchen die Rolle dieser regulatorischen RNAs sowie den Einfluß posttranslationaler Modificationen von NoRC auf die Chromatinstruktur sowie die Transkriptionsaktivität und genomische Stabilität der rDNA. Wir erwarten von diesen Arbeiten Aufschlüsse über die Mechanismen, die den aktiven und inaktiven Status ribosomaler Gene vererben und deren Ausfall kausal für das Entstehen von Krankheiten verantwortlich ist.

http://www.dkfz.de/de/polymerase

Technologien

ChIP, RNA immunoprecipitations, protein-DNA-and protein-RNA analysis, bisulfite mutagenesis, nucleosome positioning, RNA analysis

Publikationen

Strohner, R., Nemeth, A., Jansa, P., Hoffmann-Rohrer, U., Santoro, R., Längst, G., Grummt, I.: NoRC – a novel member of mammalian ISWI-containing chromatin remodeling machines. EMBO J. (2001) 20, 4892-4900.

Santoro, R., Li, J., Grummt, I.: The nucleolar remodeling complex NoRC mediates heterochromatin formation and silencing of ribosomal gene transcription. Nature Genetics (2002) 32, 393-396.

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Kontakt

Prof. Dr. Ingrid Grummt
Deutsches Krebsforschungszentrum
Molekularbiologie der Zelle II
Im Neuenheimer Feld 581
69120 Heidelberg, Germany

Telefon: +49 6221 423423
Fax: +49 6221 423467

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