Gene silencing by RNAi and DNA Methylation.


Abstrakt
In letzter Zeit wurden wesentliche Teile der RNA Interferenz (RNAi) Maschinerie identifiziert, die in den meisten Eukaryoten Posttranscriptional Gene Silencing auslöst. Wichtige Funktionen bei der Regulation endogener Gene sind jedoch nach wie vor unklar. Die Rolle RNA abhängiger RNA Polymerasen (RdRPs) ist zwar teilweise bekannt, aber in welchen Komplexen sie agieren und warum Drosophila und Säuger ohne diese Enzyme auskommen, ist ungeklärt. Angesichts wachsender Informationen zu endogenen Antisense RNAs stellt sich die Frage nach der Verbindung zwischen Antisense und RNAi vermitteltem Gene Silencing. In Pflanzen und S. pombe ist die Verbindung zwischen RNAi Mechanismen und Transcriptional Gene Silencing (TGS) inzwischen nachgewiesen. Während in Pflanzen RNA vermittelte DNA Methylierung stattfindet, wird in Hefe in Abhängigkeit von RNAi Hetrochromatin jedoch ohne DNA Methylierung aufgebaut. Dictyostelium gehört zu den einfachsten Organismen, die ein RdRP abhängiges RNAi System besitzen und gleichzeitig genetische Hinweise sowie alle erforderlichen Komponenten für TGS enthalten. Außerdem bietet Dictyostelium einen direkten Vergleich zwischen Antisense und RNAi und wir konnten zeigen, dass sich diese Mechanismen unterscheiden. Mit den Werkzeugen und Informationen aus der ersten Förderperiode wollen wir RNAi, Antisense und TGS genauer definieren und ihre Funktion in vivo analysieren.
Keywords: Methylation, RNA interference, RdRP, Histone modification, Dicer
Am Projekt beteiligt: Markus Kaller, PhD student
Markus Kuhlmann, Postdoc DFG
Link: http://www.biologie.uni-kassel.de/genetics/

Publikationen

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Wolfgang Nellen
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